世界上一共有多少种狗狗？
世界上的狗狗大概有400多种，但能够被人类驯化的可能还不到50种，目前尚未发现有新的犬品种被认可。 作为全球唯一一种人类驯养的家畜，狗在进化上几乎从未离开过人类。它们无法自由地选择自己的伴侣并生育后代，所有的繁衍都离不开人类的干预，因此它们的基因库与人类基因库的交流是紧密相连的。
不同品种的狗狗虽然外表有所差别，但我们发现的证据表明，这些差异本质上是由基因突变引起的，只涉及到几个基因座，从而造成许多品种“表面”遗传相似的结果；而内在（非显性）基因的差异却有可能非常大。 人类和狗狗都是相互依赖、共同进化的物种。在过去的1万年中，人们不断地选育不同的品种来满足工作或娱乐的需要，如用来看家护院、狩猎、拉车、导盲和宠物等。而被人类驯化、饲养的犬类的祖先很可能就是今天所发现的灰狼。
尽管有大量的科学论文探讨了人和动物的基因组，但是人类基因组和动物基因组的完整序列仍然需要花很长时间才能够完成。然而，科学家们已经发现了一些与人类关系密切的分子标记。在这些位置，不同物种之间的基因排列是相同的，即所谓“单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）”。
通过检测这些分子标记，我们可以大致判断特定基因型是在人类还是动物基因组中发现的。利用这项技术，我们能够在很大程度上确定不同品系的狗狗之间的遗传差异。 目前，已知的与人类关系最密切的动物种类之一就是老鼠。对老鼠基因组的深入研究能帮助我们理解人类的一些遗传疾病，以及开发新药物的潜在靶点。
除了小鼠以外，果蝇、线虫等常见模式生物也参与了我们的研究。
随着我们对人兽相互作用的了解不断加深，新的问题也会相继出现，我们迫切需要建立一套有效的方法来解决这些问题。